В журнале «Nature» опубликована статья Консорциума «GenomeAsia100K», участниками которого являются сотрудники НИИ медицинской генетики
НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ РАН принимает активное участие в реализации международного проекта по полногеномному секвенированию 100 000 представителей различных коренных народов Азии (GenomeAsia 100K Project).
4 декабря 2019 года в журнале «Nature» опубликована статья Консорциума «GenomeAsia100K», участниками которого являются сотрудники лаборатории эволюционной генетики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ член-корр. РАН Вадим Анатольевич Степанов и д-р биол. наук Владимир Николаевич Харьков:
Wall JD, Stawiski EW, Ratan A, Kim HL, Kim C, Gupta R, Suryamohan K, Gusareva ES, Purbojati RW, Bhangale T, Stepanov V, Kharkov V, Schröder MS, Ramprasad V, Tom J, Durinck S, Bei Q, Li J, Guillory J, Phalke S, Basu A, Stinson J, Nair S, Malaichamy S, Biswas NK, Chambers JC, Cheng KC, George JT, Khor SS, Kim JI, Cho B, Menon R, Sattibabu T, Bassi A, Deshmukh M, Verma A, Gopalan V, Shin JY, Pratapneni M, Santhosh S, Tokunaga K, Md-Zain BM, Chan KG, Parani M, Natarajan P, Hauser M, Allingham RR, Santiago-Turla C, Ghosh A, Gadde SGK, Fuchsberger C, Forer L, Schoenherr S, Sudoyo H, Lansing JS, Friedlaender J, Koki G, Cox MP, Hammer M, Karafet T, Ang KC, Mehdi SQ, Radha V, Mohan V, Majumder PP, Seshagiri S, Seo JS, Schuster SC, Peterson AS. The GenomeAsia 100K Project enables genetic discoveries across Asia. // Nature. 2019 Dec; 576(7785):106-111. - doi: 10.1038/s41586-019-1793-z. Epub 2019 Dec. –URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31802016
В настоящее время образцы из азиатских популяций недостаточно представлены в геномных исследованиях человека, что приводит к снижению фундаментальной и прикладной (в том числе медицинской) составляющей этой области исследования генетики человека.
Изучение структуры геномов отдельных представителей различных народов и репрезентативных популяционных выборок, а также полногеномные исследования ассоциаций в различных популяциях необходимы для решения этой проблемы.
В первой статье по результатам реализации GnomeAsia 100K Project приведены итоги реализации пилотной части этого научного проекта. В работе приведены результаты секвенирования полных геномов 1739 человек из 219 групп населения 64 стран Азии. Были каталогизированы генетические особенности геномов, структура популяций, ассоциации различных болезней и генетико-демографические особенности, такие как эффект основателя и следы древних миграций в генофонде современного населения.
Данные полученные в ходе проекта могут быть эффективно использованы для различных генетических исследований азиатских популяций по всему миру и для сравнительного анализа с другими народами и региональными группами населения.
Источник: Новости Томского НИМЦ